2013年9月8日第一条微博开始，对转基因毫无了解的崔永元，突然卷入了挺转与反转的漩涡。凭着一指禅的打字速度，他敲短句，也偶尔写长文，竟论战半年之久。有人钦佩他的勇气和执著，用投票用跟帖表达拥护；也有人斥责他为彻底的外行，“小学生”，造谣者；还有一些人，私下劝他适可而止，“急流勇退”，别误了自己的名声和正事。他自己说，在中央电视台那么久，“我什么都不争”，但这次却要寸土不让，干好两件事——对于方舟子，以其人之道还治其人之身，对战终于演变成了“文革式”的骂战；另一件事则是调查转基因真相，“这是个严肃的事”，他说自己自费近100万元，已经四次赴美、日实地调查，越发觉得谎言四布：科学界对转基因的安全性并非没有分歧；美国也有反转派，美国人并非放心地吃了20年，等等。